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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3rpwA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: abc transporter; | PDBTitle: the crystal structure of an abc transporter from rhodopseudomonas2 palustris cga009 |
Added to library: Sat May 14 09:09:30 2011 | |
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Sequence | Q | S | N | V | V | I | X | Q | D | P | G | G | G | Y | G | D | A | L | R | K | V | X | Y | D | P | F | E | K | E | T | G | I | K | V | V | T | V | Q | E | A | R | S | G | P | R | I | K | A | Q | A | E | A | G | K | A | Q | W | D | L | T | F | I | F | D | Q | E | T | K | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | T | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | C | C | L | A | D | I | D | Y | S | K | L | S | E | S | A | H | K | T | L | A | A | X | P | D | N | L | K | R | K | K | G | V | A | L | Q | V | I | G | V | G | L | V | Y | N | K | D | K | F | K | G | D | K | A | P | Q | T | W | A | D | F | W | D | V | K | K | F | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | C | X | P | A | W | P | R | F | T | F | E | A | A | L | X | A | D | G | V | T | K | D | K | L | Y | P | I | D | X | D | R | A | L | K | K | L | K | E | I | K | P | H | V | V | K | W | W | T | T | A | A | Q | P | P | Q | L | I | L | D | G | E | A | D | X | C | L | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | G | S | X | S | K | L | A | L | E | G | A | P | I | D | L | T | F | N | Q | G | F | V | Y | Y | D | F | F | S | I | P | K | G | A | P | N | Y | D | N | A | L | K | L | L | S | W | R | L | D | P | K | R | A | A | Q | L | T | S | T | F | P | V | A | L | P | S | K | V | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | |||||
Sequence | D | A | A | T | D | K | N | I | A | R | Y | W | A | N | N | P | E | N | V | A | K | A | I | E | W | S | P | D | F | W | G | A | P | S | P | A | G | N | S | T | N | E | E | Y | G | Q | E | K | L | N | A | X | L | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | S | S | B | T | T | S | S | S | B |
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