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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c3rf2A_ | PDB header: ribosomal protein | Chain: A: PDB Molecule: 30s ribosomal protein s8; | PDBTitle: crystal structure of 30s ribosomal protein s8 from aquifex aeolicus | 
| Added to library: Sat Nov 19 19:40:01 2011 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | V | D | P | I | A | D | M | F | S | A | I | K | N | A | I | M | R | R | D | D | F | L | Y | V | P | S | S | K | L | K | E | R | I | L | D | V | L | K | K | E | G | F | I | Q | D | W | E | A | L | K | G | E | K | Y | E | E | E | Y | K | K | M | K | E | L | A | E | K | S | P | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | P | K | M | K | R | Y | L | K | Q | L | E | E | Y | N | K | G | T | Q | Y | P | I | K | I | Y | L | K | Y | L | D | P | K | K | R | K | S | A | I | T | N | I | V | K | V | S | K | G | G | R | R | V | Y | A | G | V | R | T | M | P | Y | V | K | R | G | L | G | I | A | I | V | S | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | T | T |  |  |  |  |  |  | B | S | S | T | T | S | S | B | S | S |  |  |  | S | S | S | S |  |  | S | T | T | S | G | G | G | T | S |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | 
| Sequence | T | D | A | G | V | M | T | D | H | E | A | R | R | M | R | K | G | G | E | V | I | A | F | V | W | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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