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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3rd5A_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: mypaa.01249.c; | PDBTitle: crystal structure of a putative uncharacterized protein from2 mycobacterium paratuberculosis |
Added to library: Sat Apr 23 14:32:01 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | G | W | T | A | A | D | L | P | S | F | A | Q | R | T | V | V | I | T | G | A | N | S | G | L | G | A | V | T | A | R | E | L | A | R | R | G | A | T | V | I | M | A | V | R | D | T | R | K | G | E | A | A | A | R | T | M | A | G | Q | V | E | V | R | E | L | D | L | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | S | V | R | R | F | A | D | G | V | S | G | A | D | V | L | I | N | N | A | G | I | M | A | V | P | Y | A | L | T | V | D | G | F | E | S | Q | I | G | T | N | H | L | G | H | F | A | L | T | N | L | L | L | P | R | L | T | D | R | V | V | T | V | S | S | M | A | H | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | S | B | T | G | G | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | G | R | I | N | L | E | D | L | N | W | R | S | R | R | Y | S | P | W | L | A | Y | S | Q | S | K | L | A | N | L | L | F | T | S | E | L | Q | R | R | L | T | A | A | G | S | P | L | R | A | L | A | A | H | P | G | Y | S | H | T | N | L | A | T | D | A | D | F | G | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | T | L | Y | A | A | S | Q | D | L | P | G | D | S | F | V | G | P | R | F | G | Y | L | G | R | T | Q | P | V | G | R | S | R | R | A | K | D | A | G | M | A | A | A | L | W | A | L | S | E | Q | L | T | K | T | E | F | P | L | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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