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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3r6dA_ | PDB header: lyase, isomerase | Chain: A: PDB Molecule: nad-dependent epimerase/dehydratase; | PDBTitle: crystal structure of nad-dependent epimerase/dehydratase from2 veillonella parvula dsm 2008 with cz-methylated lysine |
Added to library: Sat Apr 23 08:57:21 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | A | X | Y | Y | I | T | I | L | G | A | A | G | Q | I | A | Q | L | T | A | T | L | L | T | Y | T | D | X | H | I | T | L | Y | G | R | Q | L | K | T | R | I | P | P | E | I | I | D | H | E | R | V | T | V | I | E | G | S | F | Q | N | P | G | L | E | Q | A | V | T | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | E | V | V | F | V | G | A | X | E | S | G | S | D | X | A | S | I | V | K | A | L | S | R | N | I | R | R | V | I | G | V | S | X | A | G | L | S | G | E | F | P | V | A | L | E | K | W | T | F | D | N | L | P | I | S | Y | V | Q | G | E | R | Q | A | R | N | V | L | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | N | L | N | Y | T | I | L | R | L | T | W | L | Y | N | D | P | E | T | D | Y | E | L | I | P | E | G | A | Q | F | N | D | A | Q | V | S | R | E | A | V | V | K | A | I | F | D | I | L | H | A | A | D | E | T | P | F | H | R | T | S | I | G | V | G | E | P | G | T | H | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | P | S | F | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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