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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3qxlB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: ras-specific guanine nucleotide-releasing factor ralgps1; | PDBTitle: crystal structure of the cdc25 domain from ral-specific guanine-2 nucleotide exchange factor ralgps1a |
Added to library: Sat May 14 09:01:02 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | D | V | L | K | V | T | P | E | E | F | A | S | Q | I | T | L | M | D | I | P | V | F | K | A | I | Q | P | E | E | L | A | S | C | G | W | S | K | K | E | K | H | S | L | A | P | N | V | V | A | F | T | R | R | F | N | Q | V | S | F | W | V | V | R | E | I | L | T | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | K | I | R | A | E | I | L | S | H | F | V | K | I | A | K | K | L | L | E | L | N | N | L | H | S | L | M | S | V | V | S | A | L | Q | S | A | P | I | F | R | L | T | K | T | W | A | L | L | N | R | K | D | K | T | T | F | E | K | L | D | Y | L | M | S | K | E | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | K | R | T | R | E | Y | I | R | S | L | K | M | V | P | S | I | P | Y | L | G | I | Y | L | L | D | L | I | Y | I | D | S | A | Y | P | A | S | G | S | I | M | E | N | E | Q | R | S | N | Q | M | N | N | I | L | R | I | I | A | D | L | Q | V | S | C | S | Y | H | L | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | P | H | V | Q | K | Y | L | K | S | V | R | Y | I | E | E | L | Q | K | F | V | E | D | D | N | Y | K | L | S | L | R | I | E | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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