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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3qs9F_ | PDB header: cytokine/signaling protein | Chain: F: PDB Molecule: fl cytokine receptor; | PDBTitle: crystal structure of a human flt3 ligand-receptor ternary complex |
Added to library: Sat Mar 19 09:07:47 2011 | |
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Sequence | T | L | R | R | P | Y | F | R | K | M | E | N | Q | D | A | L | V | C | I | S | E | S | V | P | E | P | I | V | E | W | V | L | C | V | V | K | K | E | E | K | V | L | H | E | L | F | G | T | D | I | R | C | C | A | R | N | E | L | G | R | E | C | T | R | L | F | T | I | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | Q | T | P | Q | T | T | L | P | Q | L | F | L | K | V | G | E | P | L | W | I | R | C | K | A | V | H | V | N | H | G | F | G | L | T | W | E | L | E | N | K | A | L | E | E | G | N | Y | F | E | M | S | T | Y | S | T | N | R | T | M | I | R | I | L | F | A | F | V | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | A | R | N | D | T | G | Y | Y | T | C | S | S | S | K | H | P | S | Q | S | A | L | V | T | I | V | G | F | I | N | A | T | N | S | S | E | D | Y | E | I | D | Q | Y | E | E | F | C | F | S | V | R | F | K | A | Y | P | Q | I | R | C | T | W | T | F | S | R | K | S | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | E | Q | K | G | L | D | N | G | Y | S | I | S | K | F | C | N | H | K | H | Q | P | G | E | Y | I | F | H | A | E | N | D | D | A | Q | F | T | K | M | F | T | L | N | R | K | P | Q | V | L | A | E | A | S | A | S | C | F | S | D | G | Y | P | L | P | S | W | T | W | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | C | S | C | T | E | E | I | T | E | G | V | W | N | R | W | V | S | S | S | T | L | N | M | S | E | A | I | K | G | F | L | V | K | C | C | A | Y | N | S | L | G | T | S | C | E | T | I | L | L | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
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