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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c3q75A_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: farnesyltransferase alpha subunit; | PDBTitle: cryptococcus neoformans protein farnesyltransferase in complex with2 fpt-ii and tkcvvm peptide | 
| Added to library: Sat Aug 6 09:55:15 2011 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | T | Y | I | P | M | S | Q | R | R | S | W | A | D | V | K | P | I | M | Q | D | D | G | P | N | P | V | V | P | I | M | Y | S | E | E | Y | K | D | A | M | D | Y | F | R | A | I | A | A | K | E | E | K | S | E | R | A | L | E | L | T | E | I | I | V | R | M | N | P | A | H | Y | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | T | V | W | Q | Y | R | F | S | L | L | T | S | L | N | K | S | L | E | D | E | L | R | L | M | N | E | F | A | V | Q | N | L | K | S | Y | Q | V | W | H | H | R | L | L | L | L | D | R | I | S | P | Q | D | P | V | S | E | I | E | Y | I | H | G | S | L | L | P | D | P | K | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | Y | H | T | W | A | Y | L | H | W | L | Y | S | H | F | S | T | L | G | R | I | S | E | A | Q | W | G | S | E | L | D | W | C | N | E | M | L | R | V | D | G | R | N | N | S | A | W | G | W | R | W | Y | L | R | V | S | R | P | G | A | E | T | S | S | R | S | L | Q | D | E | L | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | 
| Sequence | I | Y | I | L | K | S | I | H | L | I | P | H | N | V | S | A | W | N | Y | L | R | G | F | L | K | H | F | S | L | P | L | V | P | I | L | P | A | I | L | P | Y | T | A | F | P | M | P | S | D | L | P | E | D | T | P | L | P | V | P | L | A | L | E | Y | L | A | D | S | F | I | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | 
| Sequence | E | Q | N | R | V | D | D | A | A | K | V | F | E | K | L | S | S | E | Y | D | Q | M | R | A | G | Y | W | E | F | R | R | R | E | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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