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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3pssB_ | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: qnr; | PDBTitle: crystal structure of ahqnr, the qnr protein from aeromonas hydrophila2 (p21 crystal form) |
Added to library: Sat Jan 29 08:39:31 2011 | |
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Sequence | M | I | D | C | F | E | G | V | R | F | E | Q | Q | D | L | E | G | E | Q | F | Q | G | C | R | F | I | G | C | N | F | S | W | L | D | L | A | E | C | R | F | V | D | C | S | F | Y | D | R | E | S | E | Q | S | C | L | L | Q | G | C | D | L | R | E | A | S | F | L | R | C | D |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | ![]() | ![]() | S | B | G | G | G | G | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | ![]() | ![]() | S | B | T | T | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | B | T | T | T | T | B | B | T | T | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | M | A | D | C | S | R | S | Q | C | L | G | L | E | L | R | D | C | Q | A | L | G | I | N | F | S | R | A | S | F | A | N | Q | I | T | V | S | Y | F | C | E | A | H | L | T | G | N | N | F | S | Y | A | N | F | E | G | C | L | L | E | Q | C | E | L | S | G | N | R | W |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | T | T | B | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | G | A | N | L | F | G | A | S | L | A | G | S | D | L | S | G | S | E | F | G | Q | I | D | W | A | S | V | N | L | Q | G | C | D | L | R | Q | C | D | L | P | G | L | D | L | R | R | V | N | L | D | G | V | Q | I | N | E | D | Q | Q | Q | A | L | L | E | Q | I | G | L | I |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | S | G | G | G | S | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | B | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | V | F | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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