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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3pq1B_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: poly(a) rna polymerase; | PDBTitle: crystal structure of human mitochondrial poly(a) polymerase (papd1) |
Added to library: Wed Jan 9 22:46:38 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | F | S | E | X | Q | N | E | R | R | E | Q | A | Q | R | T | V | L | I | H | C | P | E | K | N | N | H | F | F | Y | E | S | F | G | L | Y | A | V | V | E | F | I | G | S | L | Q | N | G | N | K | Q | L | F | E | L | L | C | Y | A | E | S | I | D | D | Q | L | N | T | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | F | Q | L | T | E | E | N | T | K | L | R | Y | L | T | C | S | L | I | E | D | X | A | A | A | Y | F | P | D | C | I | V | R | P | F | G | S | S | V | N | T | F | G | K | L | G | C | D | L | D | X | F | L | D | L | D | N | L | S | A | H | K | I | S | G | L | X | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | V | K | N | V | P | S | E | R | I | A | T | Q | K | I | L | S | V | L | G | E | C | L | D | H | F | G | P | G | C | V | G | V | Q | K | I | L | N | A | R | C | P | L | V | R | F | S | H | Q | A | S | G | F | Q | C | A | L | T | T | N | N | R | I | A | L | T | S | S | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | Y | I | Y | G | A | L | D | S | R | V | R | A | L | V | F | S | V | R | C | W | A | R | A | H | W | I | T | N | F | S | L | T | X | X | V | I | F | F | L | Q | R | R | S | Q | N | T | E | T | L | E | L | L | L | K | E | F | F | E | Y | F | G | N | X | X | X | X | X | X | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | ||||||||||||||||||
Sequence | X | X | X | S | Q | S | Q | L | Q | K | F | V | D | L | A | R | E | S | A | W | I | L | Q | Q | E | D | T | D | S | S | N | R | P | W | G | L | V | S | L | L | L | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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