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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3pm8B_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: calcium-dependent protein kinase 2; | PDBTitle: cad domain of pff0520w, calcium dependent protein kinase |
Added to library: Sat Dec 11 14:06:41 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | G | H | V | E | L | S | S | T | L | L | K | N | L | K | N | F | K | K | E | N | E | L | K | K | I | A | L | T | I | I | A | K | H | L | C | D | V | E | I | N | N | L | R | N | I | F | I | A | L | D | V | D | N | S | G | T | L | S | S | Q | E | I | L | D | G | L | K | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | P | D | I | H | Q | V | L | R | D | I | D | S | N | A | S | G | Q | I | H | Y | T | D | F | L | A | A | T | I | D | K | Q | T | Y | L | K | K | E | V | C | L | I | P | F | K | F | F | D | I | D | G | N | G | K | I | S | V | E | E | L | K | R | I | F | G | R | D | D | I | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | P | L | I | D | K | A | I | D | S | L | L | Q | E | V | D | L | N | G | D | G | E | I | D | F | H | E | F | M | L | M | M | S | K | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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