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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3pl6C_ | PDB header: immune system | Chain: C: PDB Molecule: t-cell receptor alpha chain; | PDBTitle: structure of autoimmune tcr hy.1b11 in complex with hla-dq1 and mbp2 85-99 |
Added to library: Wed Jan 9 22:38:34 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | N | V | E | Q | H | P | S | T | L | S | V | Q | E | G | D | S | A | V | I | K | C | T | Y | S | D | S | A | S | N | Y | F | P | W | Y | K | Q | E | L | G | K | R | P | Q | L | I | I | D | I | R | S | N | V | G | E | K | K | D | Q | R | I | A | V | T | L | N | K | T | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | F | S | L | H | I | T | E | T | Q | P | E | D | S | A | V | Y | F | C | A | A | S | S | F | G | N | E | K | L | T | F | G | T | G | T | R | L | T | I | I | P | N | I | Q | N | P | D | P | A | V | Y | Q | L | R | D | S | K | S | S | D | K | S | V | C | L | F | T | D | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | ||||||
Sequence | S | Q | T | N | V | S | Q | S | K | D | S | D | V | Y | I | T | D | K | C | V | L | D | M | R | S | M | D | F | K | S | N | S | A | V | A | W | S | N | K | S | D | F | A | C | A | N | A | F | N | N | S | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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