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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3peuB_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: nucleoporin gle1; | PDBTitle: s. cerevisiae dbp5 l327v c-terminal domain bound to gle1 h337r and ip6 |
Added to library: Sat Mar 26 08:49:04 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | N | F | D | K | I | S | K | X | F | W | H | Y | K | D | K | I | A | Q | I | K | Q | D | I | V | L | P | I | K | K | A | D | V | N | V | R | N | L | L | S | R | H | K | R | K | I | N | P | K | F | G | Q | L | T | N | S | N | Q | Q | L | F | K | I | Q | N | E | L | T | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | N | D | T | K | G | D | S | L | A | Y | H | W | I | L | N | F | I | A | K | A | V | V | R | Q | A | E | T | E | V | R | V | K | P | E | S | A | L | P | L | G | K | L | T | L | Y | L | L | V | Q | F | P | E | L | Q | E | L | F | X | A | R | L | V | K | K | C | P | F | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | F | T | C | E | I | D | T | E | K | G | R | Q | N | X | G | W | K | R | N | N | E | N | K | W | E | D | N | T | S | Y | D | E | R | X | G | G | I | L | S | L | F | A | I | I | T | R | L | Q | L | P | Q | E | F | I | T | T | T | S | H | P | F | P | I | A | L | S | W | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | B | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | A | R | I | C | N | T | P | L | N | L | I | T | N | T | H | F | V | I | L | G | S | W | W | D | A | A | A | V | Q | F | L | Q | A | Y | G | N | Q | A | S | K | L | L | I | L | I | G | E | E | L | T | S | R | X | A | E | K | K | Y | V | G | A | A | R | L | R | I | L | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | W | Q | N | N | N | X | E | S | F | P | E | X | S | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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