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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3p73A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: mhc rfp-y class i alpha chain; | PDBTitle: crystal structures of the chicken yf1*7.1 molecule |
Added to library: Sat Dec 11 14:32:24 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | G | S | H | S | L | R | Y | F | L | T | G | M | T | D | P | G | P | G | M | P | R | F | V | I | V | G | Y | V | D | D | K | I | F | G | T | Y | N | S | K | S | R | T | A | Q | P | I | V | E | M | L | P | Q | E | D | Q | E | H | W | D | T | Q | T | Q | K | A | Q | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | R | D | F | D | W | N | L | N | R | L | P | E | R | Y | N | K | S | K | G | S | H | T | M | Q | M | M | F | G | C | D | I | L | E | D | G | S | I | R | G | Y | D | Q | Y | A | F | D | G | R | D | F | L | A | F | D | M | D | T | M | T | F | T | A | A | D | P | V | A | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | K | R | R | W | E | T | E | G | T | Y | A | E | R | W | K | H | E | L | G | T | V | C | V | Q | N | L | R | R | Y | L | E | H | G | K | A | A | L | K | R | R | V | Q | P | E | V | R | V | W | G | K | E | A | D | G | I | L | T | L | S | C | H | A | H | G | F | Y | P | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | I | T | I | S | W | M | K | D | G | M | V | R | D | Q | E | T | R | W | G | G | I | V | P | N | S | D | G | T | Y | H | A | S | A | A | I | D | V | L | P | E | D | G | D | K | Y | W | C | R | V | E | H | A | S | L | P | Q | P | G | L | F | S | W | E | P | Q | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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