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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3p5nA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: riboflavin uptake protein; | PDBTitle: structure and mechanism of the s component of a bacterial ecf2 transporter |
Added to library: Sat Nov 6 12:00:32 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | Q | N | K | R | L | I | T | I | S | M | L | S | A | I | A | F | V | L | T | F | I | K | F | P | I | P | F | L | P | P | Y | L | T | L | D | F | S | D | V | P | S | L | L | A | T | F | T | F | G | P | V | A | G | I | I | V | A | L | V | K | N | L | L | N | Y | L | F | S | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | P | V | G | P | F | A | N | F | L | A | G | A | S | F | L | L | T | A | Y | A | I | Y | K | N | K | R | S | T | K | S | L | I | T | G | L | I | I | A | T | I | V | M | T | I | V | L | S | I | L | N | Y | F | V | L | L | P | L | Y | G | M | K | V | I | I | V | S | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | P | F | N | I | I | K | G | I | V | I | S | I | V | F | I | L | L | Y | R | R | L | A | N | F | L | K | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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