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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3p1iC_ | PDB header: transferase,signaling protein | Chain: C: PDB Molecule: ephrin type-b receptor 3; | PDBTitle: ligand binding domain of human ephrin type-b receptor 3 |
Added to library: Wed Jan 9 14:39:04 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | E | T | L | M | D | T | K | W | V | T | S | E | L | A | W | T | S | H | P | E | S | G | W | E | E | V | S | G | Y | D | E | A | M | N | P | I | R | T | Y | Q | V | C | N | V | R | E | S | S | Q | N | N | W | L | R | T | G | F | I | W | R | R | D | V | Q | R | V | Y | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | K | F | T | V | R | D | C | N | S | I | P | N | I | P | G | S | C | K | E | T | F | N | L | F | Y | Y | E | A | D | S | D | V | A | S | A | S | S | P | F | W | M | E | N | P | Y | V | K | V | D | T | I | A | P | D | E | S | F | G | R | V | N | T | K | V | R | S | F | G | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | K | A | G | F | Y | L | A | F | Q | D | Q | G | A | C | M | S | L | I | S | V | R | A | F | Y | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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