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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3oqhB_ | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: putative uncharacterized protein yvmc; | PDBTitle: crystal structure of b. licheniformis cdps yvmc-blic |
Added to library: Sat Feb 26 08:38:26 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | L | F | K | T | E | T | L | T | Q | N | C | N | E | I | L | K | R | R | R | H | V | L | V | G | I | S | P | F | N | S | R | F | S | E | D | Y | I | H | R | L | I | A | W | A | V | R | E | F | Q | S | V | S | V | L | L | A | G | K | E | A | A | N | L | L | E | A | L | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | H | G | K | A | E | R | K | V | R | K | E | V | S | R | N | R | R | F | A | E | K | A | L | E | A | H | G | G | N | P | E | D | I | H | T | F | S | D | F | A | N | Q | T | A | Y | R | N | L | R | M | E | V | E | A | A | F | F | D | Q | T | H | F | R | N | A | C | L | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | H | A | A | I | L | G | R | A | R | G | T | R | M | D | V | V | E | V | S | A | D | M | L | E | L | A | V | E | Y | V | I | A | E | L | P | F | F | I | A | A | P | D | I | L | G | V | E | E | T | L | L | A | Y | H | R | P | W | K | L | G | E | Q | I | S | R | N | E | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | K | M | R | P | N | Q | G | Y | L | M | V | S | E | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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