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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3oq3B_ | PDB header: cytokine/viral protein | Chain: B: PDB Molecule: ifn-alpha/beta binding protein c12r; | PDBTitle: structural basis of type-i interferon sequestration by a poxvirus2 decoy receptor |
Added to library: Sat May 21 09:47:00 2011 | |
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Sequence | M | I | D | I | E | N | E | I | T | E | F | F | N | K | M | R | D | T | L | P | A | K | D | S | K | W | L | N | P | S | C | M | F | G | G | T | M | N | D | M | A | A | L | G | E | P | F | S | A | K | C | P | P | I | E | D | S | L | L | S | H | R | Y | N | D | K | D | N | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | W | E | K | I | G | K | T | R | R | P | L | N | R | R | V | K | N | G | D | L | W | I | A | N | Y | T | S | N | D | S | H | R | R | Y | L | C | T | V | T | T | K | N | G | D | C | V | Q | G | I | V | R | S | H | I | R | K | P | P | S | C | I | P | E | T | Y | E | L | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | D | K | Y | G | I | D | L | Y | C | G | I | L | Y | A | K | H | Y | N | N | I | T | W | Y | K | N | N | Q | E | L | I | I | D | G | T | K | Y | S | Q | S | G | Q | N | L | I | I | H | N | P | E | L | E | D | S | G | R | Y | D | C | Y | V | H | Y | D | D | V | R | I | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | I | V | V | S | R | C | K | I | L | T | V | I | P | S | Q | D | H | R | F | K | L | I | L | D | P | K | I | N | V | T | I | G | E | P | A | N | I | T | C | T | A | V | S | T | S | L | L | V | D | D | V | L | I | D | W | E | N | P | S | G | W | I | I | G | L | D | F | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | B | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | Y | S | I | L | T | S | S | G | G | I | T | E | A | T | L | Y | F | E | N | V | T | E | E | Y | I | G | N | T | Y | T | C | R | G | H | N | Y | Y | F | D | K | T | L | T | T | T | V | V | L | E | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S |
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