|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3op0B_ | PDB header: signaling protein/signaling protein regu | Chain: B: PDB Molecule: signal transduction protein cbl-c; | PDBTitle: crystal structure of cbl-c (cbl-3) tkb domain in complex with egfr2 py1069 peptide |
Added to library: Thu Oct 28 12:52:35 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | R | Q | W | E | E | A | R | A | L | G | R | A | V | R | M | L | Q | R | L | E | E | Q | C | V | D | P | R | L | S | V | S | P | P | S | L | R | D | L | L | P | R | T | A | Q | L | L | R | E | V | A | H | S | R | R | E | A | G | G | G | G | P | G | G | P | G | G | S | G | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | I | Y | L | A | N | L | E | A | K | S | R | Q | V | A | A | L | L | P | P | R | G | R | R | S | A | N | D | E | L | F | R | A | G | S | R | L | R | R | Q | L | A | K | L | A | I | I | F | S | H | M | H | A | E | L | H | A | L | F | P | G | G | K | Y | C | G | H | M | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | L | T | K | A | P | A | H | T | F | W | R | E | S | C | G | A | R | C | V | L | P | W | A | E | F | E | S | L | L | G | T | H | P | V | E | P | G | T | A | L | A | L | R | T | T | I | D | L | T | S | G | H | V | S | I | F | E | F | D | V | F | T | R | L | F | Q | P | W | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | L | L | K | N | W | Q | L | L | A | V | N | H | P | G | Y | M | A | F | L | T | Y | D | E | V | Q | E | R | L | Q | A | C | R | D | K | P | G | S | Y | I | F | R | P | S | C | T | R | L | G | Q | W | A | I | G | Y | V | S | S | D | G | S | I | L | Q | T | I | P | A | N | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | G | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | P | L | S | Q | V | L | L | E | G | Q | K | D | G | F | Y | L | Y | P | D | G | K | T | H | N | P | D | L | T | E | L | G | A | E | N | L | Y | F | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|