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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3oe6A_ | PDB header: singnaling protein,hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: c-x-c chemokine receptor type 4, lysozyme chimera; | PDBTitle: crystal structure of the cxcr4 chemokine receptor in complex with a2 small molecule antagonist it1t in i222 spacegroup |
Added to library: Sat Oct 30 11:28:38 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | F | N | K | I | F | L | P | T | I | Y | S | I | I | F | L | T | G | I | V | G | N | G | L | V | I | L | V | M | G | Y | Q | K | K | L | R | S | M | T | D | K | Y | R | L | H | L | S | V | A | D | L | L | F | V | I | T | L | P | F | W | A | V | D | A | V | A | N | W | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | F | L | C | K | A | V | H | V | I | Y | T | V | N | L | Y | S | S | V | W | I | L | A | F | I | S | L | D | R | Y | L | A | I | V | H | A | T | N | S | Q | R | P | R | K | L | L | A | E | K | V | V | Y | V | G | V | W | I | P | A | L | L | L | T | I | P | D | F | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | N | V | S | E | A | D | D | R | Y | I | C | D | R | F | Y | P | N | D | L | W | V | V | V | F | Q | F | Q | H | I | M | V | G | L | I | L | P | G | I | V | I | L | S | C | Y | C | I | I | I | S | K | L | D | E | G | L | R | L | K | I | Y | K | D | T | E | G | Y | Y | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | I | G | H | L | L | T | K | S | P | S | L | N | A | A | K | S | E | L | D | K | A | I | G | R | N | T | N | G | V | I | T | K | D | E | A | E | K | L | F | N | Q | D | V | D | A | A | V | R | G | I | L | R | N | A | K | L | K | P | V | Y | D | S | L | D | A | V | R | R | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | A | L | I | N | M | V | F | Q | M | G | E | T | G | V | A | G | F | S | L | R | M | L | Q | Q | K | R | W | D | E | A | A | V | N | L | A | K | S | R | W | Y | N | Q | T | P | N | R | A | K | R | V | I | T | T | F | R | T | G | T | W | D | R | K | A | L | K | T | T | V | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | L | A | F | F | A | C | W | L | P | Y | Y | I | G | I | S | I | D | S | F | I | L | L | E | I | I | K | Q | G | C | E | F | E | N | T | V | H | K | W | I | S | I | T | E | A | L | A | F | F | H | C | C | L | N | P | I | L | Y | A | F | L | G | A | K | F | K | T | S | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T |
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