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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3odxA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: rho guanine nucleotide exchange factor 1; | PDBTitle: crystal structure of an n-terminally truncated linker-dh/ph domains of2 p115-rhogef |
Added to library: Sat Jan 8 11:07:18 2011 | |
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Sequence | P | K | S | Q | V | K | R | Q | E | V | I | S | E | L | L | V | T | E | A | A | H | V | R | M | L | R | V | L | H | D | L | F | F | Q | P | M | A | E | C | L | F | F | P | L | E | E | L | Q | N | I | F | P | S | L | D | E | L | I | E | V | H | S | L | F | L | D | R | L | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | R | Q | E | S | I | E | E | I | G | D | V | L | L | A | R | F | D | G | A | E | G | S | W | F | Q | K | I | S | S | R | F | C | S | R | Q | S | F | A | L | E | Q | L | K | A | K | Q | R | K | D | P | R | F | C | A | F | V | Q | E | A | E | S | R | P | R | C | R | R | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | D | M | I | P | T | E | M | Q | R | L | T | K | Y | P | L | L | L | Q | S | I | G | Q | N | T | E | E | P | T | E | R | E | K | V | E | L | A | A | E | C | C | R | E | I | L | H | H | V | N | Q | A | V | R | D | M | E | D | L | L | R | L | K | D | Y | Q | R | R | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | S | H | L | R | Q | S | S | D | P | L | S | E | F | K | N | L | D | I | T | K | K | K | L | V | H | E | G | P | L | T | W | R | V | T | K | D | K | A | V | E | V | H | V | L | L | L | D | D | L | L | L | L | L | Q | R | Q | D | E | R | L | L | L | K | S | H | S | L | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | L | R | L | T | S | A | M | T | R | E | V | A | T | D | H | K | A | F | Y | V | L | F | T | E | A | Q | I | Y | E | L | V | A | Q | T | V | S | E | R | K | N | W | C | A | L | I | T | E | T | A | G | S | L | K | V | P | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T |
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