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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3o37D_ | PDB header: transcription/protein binding | Chain: D: PDB Molecule: transcription intermediary factor 1-alpha; | PDBTitle: crystal structure of trim24 phd-bromo complexed with h3(1-10)k42 peptide |
Added to library: Sat Dec 18 18:31:13 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | E | D | W | C | A | V | C | Q | N | G | G | E | L | L | C | C | E | K | C | P | K | V | F | H | L | S | C | H | V | P | T | L | T | N | F | P | S | G | E | W | I | C | T | F | C | R | D | L | S | K | P | E | V | E | Y | D | C | K | K | K | T | E | G | L | V | K | L | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | D | K | R | K | C | E | R | L | L | L | F | L | Y | C | H | E | M | S | L | A | F | Q | D | P | V | P | L | T | V | P | D | Y | Y | K | I | I | K | N | P | M | D | L | S | T | I | K | K | R | L | Q | E | D | Y | S | M | Y | S | K | P | E | D | F | V | A | D | F | R | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | F | Q | N | C | A | E | F | N | E | P | D | S | E | V | A | N | A | G | I | K | L | E | N | Y | F | E | E | L | L | K | N | L | Y | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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