|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3o2uB_ | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: nedd8-conjugating enzyme ubc12; | PDBTitle: s. cerevisiae ubc12 |
Added to library: Sat Sep 18 08:54:18 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | L | K | L | R | Q | L | Q | K | K | K | Q | K | E | N | E | N | S | S | S | P | N | L | S | A | A | R | I | R | L | K | R | D | L | D | S | L | D | L | P | P | T | V | T | L | N | V | I | T | S | P | D | S | A | D | R | S | Q | S | P | K | L | E | V | I | V | R | P | D | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Y | N | Y | G | S | I | N | F | N | L | D | F | N | E | V | Y | P | I | E | P | P | K | V | V | C | L | K | K | I | F | H | P | N | I | D | L | K | G | N | V | C | L | N | I | L | R | E | D | W | S | P | A | L | D | L | Q | S | I | I | T | G | L | L | F | L | F | L | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | B | B | G | G | G | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . |
Sequence | N | P | N | D | P | L | N | K | D | A | A | K | L | L | C | E | G | E | K | E | F | A | E | A | V | R | L | T | M | S | G | G | S | I | E | H | V | K | Y | D | N | I | V | S | P | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|