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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ntsB_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: vsdc; | PDBTitle: catalytic domain of vsdc from aeromonas hydrophila |
Added to library: Sun Jun 26 11:20:16 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | A | D | E | A | L | R | Y | Y | S | A | Q | G | Y | T | L | L | N | N | Y | L | R | D | R | P | Y | K | Q | R | E | A | I | D | T | L | L | S | R | S | Y | L | N | D | E | P | T | S | A | G | E | F | D | K | A | M | K | A | Y | V | A | D | V | E | A | G | L | A | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | A | S | P | E | L | S | F | V | Y | R | G | L | A | L | D | K | P | E | L | A | A | L | K | E | Q | F | T | G | V | G | N | I | V | V | E | P | G | F | M | S | T | S | P | D | K | A | W | V | N | D | T | L | L | K | I | R | L | P | A | G | H | G | G | R | L | L | G | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | B | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | E | A | E | M | L | F | P | T | Q | T | R | L | R | V | D | R | V | V | S | S | T | S | G | D | F | D | T | L | L | N | T | I | P | T | S | D | N | R | I | K | R | L | I | E | V | S | V | L | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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