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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3nr1A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: hd domain-containing protein 3; | PDBTitle: a metazoan ortholog of spot hydrolyzes ppgpp and plays a role in2 starvation responses |
Added to library: Sat Sep 18 09:42:07 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | E | A | A | Q | L | L | E | A | A | D | F | A | A | R | K | H | R | Q | Q | R | R | K | D | P | E | G | T | P | Y | I | N | H | P | I | G | V | A | R | I | L | T | H | E | A | G | I | T | D | I | V | V | L | Q | A | A | L | L | H | D | T | V | E | D | T | D | T | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | T | T | B | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | E | V | E | L | H | F | G | A | Q | V | R | R | L | V | E | E | V | T | D | D | K | T | L | P | K | L | E | R | K | R | L | Q | V | E | Q | A | P | H | S | S | P | G | A | K | L | V | K | L | A | D | K | L | Y | N | L | R | D | L | N | R | C | T | P | E | G | W | S | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | R | V | Q | E | Y | F | E | W | A | A | Q | V | V | K | G | L | Q | G | T | N | R | Q | L | E | E | A | L | K | H | L | F | K | Q | R | G | L | T | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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