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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3nl4L_ | PDB header: immune system | Chain: L: PDB Molecule: antigen binding fragment, immunoglobulin igg - light chain; | PDBTitle: crystal structure of amyloid prefibrillar oligomer-specific rabbit fab |
Added to library: Sat Jul 23 10:24:36 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | V | V | M | T | Q | T | P | A | S | V | S | E | P | V | G | G | T | V | T | I | K | C | Q | A | S | Q | S | I | S | S | Y | L | A | W | Y | Q | Q | K | P | G | Q | R | P | R | L | L | I | Y | E | T | S | T | L | A | S | G | V | P | S | R | F | K | G | S | G | S | G | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | T | L | T | I | S | D | L | E | C | A | D | A | A | T | Y | Y | C | Q | S | T | Y | E | N | P | T | Y | V | S | F | G | G | G | T | E | V | G | V | K | G | D | P | V | A | P | T | V | L | I | F | P | P | S | A | D | L | V | A | T | G | T | V | T | I | V | C | V | A | N | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | F | P | D | V | T | V | T | W | E | V | D | G | T | T | Q | T | T | G | I | E | N | S | K | T | P | Q | N | S | A | D | C | T | Y | N | L | S | S | T | L | T | L | T | S | T | E | Y | N | S | H | K | E | Y | T | C | K | V | T | Q | G | T | T | S | V | V | Q | S | F | N | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | G |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | D | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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