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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3nf1A_ | PDB header: motor protein, transport protein | Chain: A: PDB Molecule: kinesin light chain 1; | PDBTitle: crystal structure of the tpr domain of kinesin light chain 1 |
Added to library: Sat May 28 09:34:02 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | S | S | G | R | E | N | L | Y | F | Q | G | G | G | Y | E | I | P | A | R | L | R | T | L | H | N | L | V | I | Q | Y | A | S | Q | G | R | Y | E | V | A | V | P | L | C | K | Q | A | L | E | D | L | E | K | T | S | G | H | D | H | P | D | V | A | T | M | L | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | L | V | Y | R | D | Q | N | K | Y | K | D | A | A | N | L | L | N | D | A | L | A | I | R | E | K | T | L | G | K | D | H | P | A | V | A | A | T | L | N | N | L | A | V | L | Y | G | K | R | G | K | Y | K | E | A | E | P | L | C | K | R | A | L | E | I | R | E | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | G | K | D | H | P | D | V | A | K | Q | L | N | N | L | A | L | L | C | Q | N | Q | G | K | Y | E | E | V | E | Y | Y | Y | Q | R | A | L | E | I | Y | Q | T | K | L | G | P | D | D | P | N | V | A | K | T | K | N | N | L | A | S | C | Y | L | K | Q | G | K | F | K | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | T | L | Y | K | E | I | L | T | R | A | H | E | R | E | F | G | K | P | I | W | M | H | A | E | E | R | E | E | C | T | S | F | G | E | Y | G | S | P | T | V | T | T | T | L | K | N | L | G | A | L | Y | R | R | Q | G | K | F | E | A | A | E | T | L | E | E | A | A | M | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | R | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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