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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3nepX_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: X: PDB Molecule: malate dehydrogenase; | PDBTitle: 1.55a resolution structure of malate dehydrogenase from salinibacter2 ruber |
Added to library: Tue Oct 19 11:39:42 2010 | |
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Sequence | M | K | V | T | V | I | G | A | G | N | V | G | A | T | V | A | E | C | V | A | R | Q | D | V | A | K | E | V | V | M | V | D | I | K | D | G | M | P | Q | G | K | A | L | D | M | R | E | S | S | P | I | H | G | F | D | T | R | V | T | G | T | N | D | Y | G | P | T | E | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | C | I | I | T | A | G | L | R | D | D | L | L | A | K | N | T | E | I | V | G | G | V | T | E | Q | F | V | E | G | S | P | D | S | T | I | I | V | V | A | N | P | L | D | V | M | T | Y | V | A | Y | E | A | S | G | F | P | T | N | R | V | M | G | M | A | G | V | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | R | F | R | S | F | I | A | E | E | L | D | V | S | V | R | D | V | Q | A | L | L | M | G | G | H | G | D | T | M | V | P | L | P | R | Y | T | T | V | G | G | I | P | V | P | Q | L | I | D | D | A | R | I | E | E | I | V | E | R | T | K | G | A | G | G | E | I | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T | G | G | G | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | M | G | T | S | A | W | Y | A | P | G | A | A | A | A | E | M | T | E | A | I | L | K | D | N | K | R | I | L | P | C | A | A | Y | C | D | G | E | Y | G | L | D | D | L | F | I | G | V | P | V | K | L | G | A | G | G | V | E | E | V | I | E | V | D | L | D | A | D | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Q | L | K | T | S | A | G | H | V | H | S | N | L | D | D | L | Q | R | L | R | D | E | G | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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