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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3mpxA_ | PDB header: lipid binding protein | Chain: A: PDB Molecule: fyve, rhogef and ph domain-containing protein 5; | PDBTitle: crystal structure of the dh and ph-1 domains of human fgd5 |
Added to library: Sun Aug 29 06:07:52 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | S | R | A | L | V | I | A | Q | E | L | L | S | S | E | K | A | Y | V | E | X | L | Q | H | L | N | L | D | F | H | G | A | V | X | R | A | L | D | D | X | D | H | E | D | T | L | A | R | E | E | L | R | Q | G | L | S | E | L | P | A | I | H | D | L | H | Q | G | I | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | E | E | R | L | S | N | W | E | S | Q | Q | K | V | A | D | V | F | L | A | R | E | Q | G | F | D | H | H | A | T | H | I | L | Q | F | D | R | Y | L | G | L | L | S | E | N | C | L | H | S | P | R | L | A | A | A | V | R | E | F | E | Q | S | T | A | K | H | R | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | V | V | Q | R | L | F | Q | Y | Q | V | L | L | T | D | Y | L | N | N | L | C | P | D | S | A | E | Y | D | N | T | Q | G | A | L | S | L | I | S | K | V | T | D | R | A | N | D | S | X | E | Q | G | E | N | L | Q | K | L | V | H | I | E | H | S | V | R | G | Q | G | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | Q | P | G | R | E | F | L | K | E | G | T | L | X | K | V | T | G | K | N | R | R | P | R | H | L | F | L | X | N | D | V | L | L | Y | T | Y | P | Q | K | D | G | K | Y | R | L | K | N | T | L | A | V | S | R | P | V | X | E | K | V | P | Y | A | L | K | I | E | T | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | C | L | X | L | S | A | S | S | C | A | E | R | D | E | W | Y | G | C | L | S | R | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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