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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3mlwL_ | PDB header: immune system | Chain: L: PDB Molecule: human monoclonal anti-hiv-1 gp120 v3 antibody 1006-15d fab | PDBTitle: crystal structure of anti-hiv-1 v3 fab 1006-15d in complex with an mn2 v3 peptide |
Added to library: Sun Aug 29 02:53:41 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | S | V | L | T | Q | P | P | S | A | S | G | T | P | G | Q | R | V | T | I | S | C | S | G | N | S | S | N | I | E | N | N | Y | V | Y | W | Y | Q | Q | L | P | G | S | T | P | K | L | L | I | F | R | D | D | Q | R | P | S | G | V | P | D | R | F | S | G | S | K | S | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | S | L | A | I | S | G | L | R | S | E | D | E | A | D | Y | Y | C | A | S | W | D | D | S | R | G | G | P | D | Y | V | F | G | T | G | T | K | V | T | V | L | G | Q | P | K | A | N | P | T | V | T | L | F | P | P | S | S | E | E | L | Q | A | N | K | A | T | L | V | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | B | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | I | S | D | F | Y | P | G | A | V | T | V | A | W | K | A | D | G | S | P | V | K | A | G | V | E | T | T | K | P | S | K | Q | S | N | N | K | Y | A | A | S | S | Y | L | S | L | T | P | E | Q | W | K | S | H | R | S | Y | S | C | Q | V | T | H | E | G | S | T | V | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | V | A | P | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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