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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3mk4A_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: peroxisomal biogenesis factor 3; | PDBTitle: x-ray structure of human pex3 in complex with a pex19 derived peptide |
Added to library: Sat Aug 28 21:48:41 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | Q | E | R | E | A | A | E | Y | I | A | Q | A | R | R | Q | Y | H | F | E | S | N | Q | R | T | C | N | M | T | V | L | S | M | L | P | T | L | R | E | A | L | M | Q | Q | L | N | S | E | S | L | T | A | L | L | K | N | R | P | S | N | K | L | E | I | W | E | D | L | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | F | T | R | S | T | V | A | V | Y | S | T | C | M | L | V | V | L | L | R | V | Q | L | N | I | I | G | G | Y | I | Y | L | D | N | A | T | T | I | L | A | P | P | D | V | Q | Q | Q | Y | L | S | S | I | Q | H | L | L | G | D | G | L | T | E | L | I | T | V | I | K | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | Q | K | V | L | G | S | V | S | L | K | H | S | L | S | L | L | D | L | E | Q | K | L | K | E | I | R | N | L | V | E | Q | H | L | L | S | H | Y | M | M | P | D | E | E | T | L | S | P | R | D | I | T | T | I | K | L | L | N | E | T | R | D | M | L | E | S | P | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | G | G | G | G | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | T | V | L | N | T | C | L | N | R | G | F | S | R | L | L | D | N | M | A | E | F | F | R | V | S | L | P | L | A | K | I | I | P | I | V | N | G | Q | I | H | S | V | C | S | E | T | P | S | H | F | V | Q | D | L | L | T | M | E | Q | V | K | D | F | A | A | N | V | Y | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | F | S | T | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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