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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ltjA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: alpharep-4; | PDBTitle: structure of a new family of artificial alpha helicoidal repeat2 proteins (alpha-rep) based on thermostable heat-like repeats |
Added to library: Tue Oct 19 11:32:42 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | T | D | P | E | K | V | E | M | Y | I | K | N | L | Q | D | D | S | Y | Y | V | R | R | A | A | A | Y | A | L | G | K | I | G | D | E | R | A | V | E | P | L | I | K | A | L | K | D | E | D | A | W | V | R | R | A | A | A | D | A | L | G | Q | I | G | D | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | E | P | L | I | K | A | L | K | D | E | D | G | W | V | R | Q | S | A | A | V | A | L | G | Q | I | G | D | E | R | A | V | E | P | L | I | K | A | L | K | D | E | D | W | F | V | R | I | A | A | A | F | A | L | G | E | I | G | D | E | R | A | V | E | P | L | I | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | ||
Sequence | L | K | D | E | D | G | W | V | R | Q | S | A | A | D | A | L | G | E | I | G | G | E | R | V | R | A | A | M | E | K | L | A | E | T | G | T | G | F | A | R | K | V | A | V | N | Y | L | E | T | H | K | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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