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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3lr1A_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: tungstate abc transporter, periplasmic tungstate- | PDBTitle: the crystal structure of the tungstate abc transporter from2 geobacter sulfurreducens |
Added to library: Sun Aug 29 00:27:07 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | A | E | E | R | L | K | X | S | T | T | T | S | T | Q | D | S | G | L | L | K | V | L | L | P | P | F | E | K | K | N | N | V | K | V | D | V | I | A | V | G | T | G | Q | A | L | K | L | G | E | A | G | D | V | D | V | V | F | V | H | A | R | K | L | E | D | K | F | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | F | G | V | N | R | K | D | V | X | Y | N | D | F | V | I | V | G | P | K | N | D | P | A | G | I | A | K | A | K | T | A | A | E | A | L | K | L | L | A | T | K | G | A | T | F | I | S | R | G | D | K | S | G | T | H | T | K | E | L | D | L | W | K | S | A | G | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | K | G | N | W | Y | V | E | A | G | Q | G | X | G | P | V | I | T | X | A | T | E | R | R | A | Y | T | L | T | D | R | G | T | Y | N | A | F | K | G | A | K | T | D | L | V | I | L | F | Q | G | L | F | N | P | Y | G | I | X | A | V | N | P | K | K | F | P | H | V | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | B | T | T | T | B | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | L | A | X | K | L | I | D | Y | V | T | G | P | E | G | L | K | I | I | S | D | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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