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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3l9bA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: otoferlin; | PDBTitle: crystal structure of rat otoferlin c2a |
Added to library: Sat Jan 22 08:47:23 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | H | M | A | L | I | V | H | L | K | T | V | S | E | L | R | G | R | A | D | R | I | A | K | V | T | F | R | G | Q | S | F | Y | S | R | V | L | E | N | C | E | D | V | A | D | F | D | E | T | F | R | W | P | V | A | S | S | I | D | R | N | E | V | L | E | I | Q | I | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | ||||
Sequence | Y | S | K | V | F | S | N | K | L | I | G | T | F | R | M | V | L | Q | K | V | V | E | E | N | R | V | E | V | S | D | T | L | I | D | D | N | N | A | I | I | K | T | S | L | S | M | E | V | R | Y | Q | A | A | D | G | T | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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