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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3l6dB_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: putative oxidoreductase; | PDBTitle: crystal structure of putative oxidoreductase from2 pseudomonas putida kt2440 |
Added to library: Sat Aug 28 15:56:50 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | S | D | E | S | F | E | F | D | V | S | V | I | G | L | G | A | X | G | T | I | X | A | Q | V | L | L | K | Q | G | K | R | V | A | I | W | N | R | S | P | G | K | A | A | A | L | V | A | A | G | A | H | L | C | E | S | V | K | A | A | L | S | A | S | P | A | T | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | L | D | N | H | A | T | H | E | V | L | G | X | P | G | V | A | R | A | L | A | H | R | T | I | V | D | Y | T | T | N | A | Q | D | E | G | L | A | L | Q | G | L | V | N | Q | A | G | G | H | Y | V | K | G | X | I | V | A | Y | P | R | N | V | G | H | R | E | S | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | H | T | G | D | R | E | A | F | E | Q | H | R | A | L | L | E | G | L | A | G | H | T | V | F | L | P | W | D | E | A | L | A | F | A | T | V | L | H | A | H | A | F | A | A | X | V | T | F | F | E | A | V | G | A | G | D | R | F | G | L | P | V | S | K | T | A | R | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | E | T | S | R | F | F | V | A | D | A | L | E | E | A | V | R | R | L | E | T | Q | D | F | K | G | D | Q | A | R | L | D | V | H | A | D | A | F | A | H | I | A | Q | S | L | H | A | Q | G | V | W | T | P | V | F | D | A | V | C | Q | V | V | Q | R | A | A | A | X | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | D | Q | D | I | A | A | T | T | K | S | F | A | R | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | G | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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