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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3kdpD_ | PDB header: hydrolase | Chain: D: PDB Molecule: sodium/potassium-transporting atpase subunit | PDBTitle: crystal structure of the sodium-potassium pump |
Added to library: Sat Aug 28 16:45:17 2010 | |
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Sequence | N | S | E | K | K | E | F | L | G | R | T | G | G | S | W | F | K | I | L | L | F | Y | V | I | F | Y | G | C | L | A | G | I | F | I | G | T | I | Q | V | M | L | L | T | I | S | E | F | K | P | T | Y | Q | D | R | V | A | P | P | G | L | T | Q | I | P | Q | S | Q | K | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | F | R | P | N | D | P | Q | S | Y | E | S | Y | V | V | S | I | V | R | F | L | E | K | Y | K | D | L | A | Q | K | D | D | M | I | F | E | D | C | G | N | V | P | S | E | L | K | E | R | G | E | Y | N | N | E | R | G | E | R | K | V | C | R | S | R | L | E | W | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | C | S | G | L | N | D | E | T | Y | G | Y | K | D | G | K | P | C | V | I | I | K | L | N | R | V | L | G | F | K | P | K | P | P | K | N | E | S | L | E | T | Y | P | V | M | K | Y | N | P | Y | V | L | P | V | H | C | T | G | K | R | D | E | D | K | E | K | V | G | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | B | B | B | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | B | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | Y | F | G | L | G | G | Y | P | G | F | P | L | Q | Y | Y | P | Y | Y | G | K | L | L | Q | P | K | Y | L | Q | P | L | M | A | V | Q | F | T | N | L | T | M | D | T | E | I | R | I | E | C | K | A | Y | G | E | N | I | G | Y | S | E | K | D | R | F | Q | G | R | F | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | S | S | B | T | T | T | S | T | T | B | B | S | S | B | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | I | E | V | K | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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