|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3k6wA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: solute-binding protein ma_0280; | PDBTitle: apo and ligand bound structures of moda from the archaeon2 methanosarcina acetivorans |
Added to library: Sat Aug 28 23:48:56 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | E | V | L | T | V | F | H | A | G | S | L | S | V | P | F | E | E | L | E | A | E | F | E | A | Q | H | P | G | V | D | V | Q | R | E | A | A | G | S | A | Q | S | V | R | K | I | T | E | L | G | K | K | A | D | V | L | A | S | A | D | Y | A | L | I | P | S | L | M | V | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | A | D | W | Y | A | A | F | A | R | N | Q | M | I | L | A | Y | T | N | E | S | K | Y | G | D | E | I | N | T | D | N | W | Y | E | I | L | R | R | P | D | V | R | Y | G | F | S | N | P | N | D | D | P | A | G | Y | R | S | Q | M | V | T | Q | L | A | E | S | Y | Y | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | M | I | Y | D | D | L | M | L | A | N | T | G | M | T | L | T | T | E | E | N | G | T | A | L | I | H | V | P | A | S | E | E | I | S | P | N | T | S | K | I | M | L | R | S | M | E | V | E | L | S | S | A | L | E | T | G | E | I | D | Y | L | Y | I | Y | R | S | V | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | H | G | F | E | Y | V | A | L | P | P | A | I | D | L | S | S | L | E | Y | A | D | N | Y | S | K | V | Q | V | E | M | V | N | G | E | V | V | T | G | S | P | I | V | Y | G | V | T | I | P | N | N | A | E | N | S | E | L | A | T | E | F | V | A | L | L | L | G | E | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | Q | Q | I | F | I | E | N | G | Q | P | P | I | V | P | A | I | A | E | G | K | D | S | M | P | E | E | L | Q | A | L | V | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|