|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3jxgD_ | PDB header: cell adhesion | Chain: D: PDB Molecule: receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma; | PDBTitle: ca-like domain of mouse ptprg |
Added to library: Sun Aug 29 00:42:53 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | Y | W | A | Y | S | G | A | Y | G | P | E | H | W | V | T | S | S | V | S | C | G | G | S | H | Q | S | P | I | D | I | L | D | H | H | A | R | V | G | D | E | Y | Q | E | L | Q | L | D | G | F | D | N | E | S | S | N | K | T | W | M | K | N | T | G | K | T | V | A | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | K | D | D | Y | F | V | S | G | A | G | L | P | G | R | F | K | A | E | K | V | E | F | H | W | G | H | S | N | G | S | A | G | S | E | H | S | V | N | G | R | R | F | P | V | E | M | Q | I | F | F | Y | N | P | D | S | F | Q | T | A | I | S | E | N | R | I | I | G | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | I | F | F | Q | V | S | P | R | D | N | S | A | L | D | P | I | I | H | G | L | K | G | V | V | H | H | E | K | E | T | F | L | D | P | F | I | L | R | D | L | L | P | A | S | L | G | S | Y | Y | R | Y | T | G | S | L | T | T | P | P | C | S | E | I | V | E | W | I | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | B | G | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | R | P | V | P | I | S | Y | H | Q | L | E | A | F | Y | S | I | F | T | T | E | Q | Q | H | V | K | S | V | E | Y | L | R | N | N | F | R | P | Q | Q | A | L | N | D | R | V | V | S | K | S | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|