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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jxfA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta; | PDBTitle: ca-like domain of human ptprz |
Added to library: Sun Aug 29 03:58:06 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | E | I | G | W | S | Y | T | G | A | L | N | Q | K | N | W | G | K | K | Y | P | T | C | N | S | P | K | Q | S | P | I | N | I | D | E | D | L | T | Q | V | N | V | N | L | K | K | L | K | F | Q | G | W | D | K | T | S | L | E | N | T | F | I | H | N | T | G | K | T | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | N | L | T | N | D | Y | R | V | S | G | G | V | S | E | M | V | F | K | A | S | K | I | T | F | H | W | G | K | C | N | M | S | S | D | G | S | E | H | S | L | E | G | Q | K | F | P | L | E | M | Q | I | Y | C | F | D | A | D | R | F | S | S | F | E | E | A | V | K | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | L | R | A | L | S | I | L | F | E | V | G | T | E | E | N | L | D | F | K | A | I | I | D | G | V | E | S | V | S | R | F | G | K | Q | A | A | L | D | P | F | I | L | L | N | L | L | P | N | S | T | D | K | Y | Y | I | Y | N | G | S | L | T | S | P | P | C | T | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | S | T | T | B | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | D | W | I | V | F | K | D | T | V | S | I | S | E | S | Q | L | A | V | F | C | E | V | L | T | M | Q | Q | S | G | Y | V | M | L | M | D | Y | L | Q | N | N | F | R | E | Q | Q | Y | K | F | S | R | Q | V | F | S | S | Y | T | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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