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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jv3A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: intersectin-1; | PDBTitle: structure of sh3e-dh unit of murine intersectin-1l |
Added to library: Wed Jan 9 15:27:57 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | C | Q | V | I | G | M | Y | D | Y | T | A | Q | N | D | D | E | L | A | F | S | K | G | Q | I | I | N | V | L | N | K | E | D | P | D | W | W | K | G | E | V | S | G | Q | V | G | L | F | P | S | N | Y | V | K | L | T | T | D | M | D | P | S | Q | Q | W | C | S | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | T | T | B | B | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | L | L | D | M | L | T | P | T | E | R | K | R | Q | G | Y | I | H | E | L | I | V | T | E | E | N | Y | V | N | D | L | Q | L | V | T | E | I | F | Q | K | P | L | T | E | S | E | L | L | T | E | K | E | V | A | M | I | F | V | N | W | K | E | L | I | M | C | N | I | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | A | L | R | V | R | K | K | M | S | G | E | K | M | P | V | K | M | I | G | D | I | L | S | A | Q | L | P | H | M | Q | P | Y | I | R | F | C | S | C | Q | L | N | G | A | A | L | I | Q | Q | K | T | D | E | A | P | D | F | K | E | F | V | K | R | L | A | M | D | P | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | T | T | T | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | C | K | G | M | P | L | S | S | F | I | L | K | P | M | Q | R | V | T | R | Y | P | L | I | I | K | N | I | L | E | N | T | P | E | N | H | P | D | H | S | H | L | K | H | A | L | E | K | A | E | E | L | C | S | Q | V | N | E | G | V | R | E | K | E | N | S | D | R | L | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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