|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3jd5a_ | 7.00 | PDB header: ribosome | Chain: A: PDB Molecule: 28s ribosomal rna, mitochondial; |
Added to library: Sat Jul 16 08:15:01 2016 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | K | P | T | F | M | D | E | E | V | Q | S | I | L | I | K | M | T | G | L | D | L | L | K | I | F | K | P | A | V | Q | E | T | K | P | P | T | Y | K | L | M | T | Q | A | Q | L | E | E | A | T | R | Q | A | I | E | A | A | K | V | R | L | K | M | P | P | V | L | E | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | I | N | D | V | L | A | E | D | K | I | L | E | G | T | E | T | G | K | Y | V | F | T | D | I | S | Y | S | I | P | H | R | E | R | F | I | V | V | R | E | P | S | G | T | L | R | K | A | S | W | E | E | R | D | R | M | I | Q | I | Y | F | P | K | E | G | R | R | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | P | V | I | F | R | E | E | N | L | Q | T | M | Y | S | Q | D | R | H | V | D | V | L | N | L | C | V | A | Q | F | E | P | D | S | A | D | Y | I | K | V | H | H | Q | T | Y | E | D | I | D | K | Y | G | K | Y | D | L | L | R | S | T | R | H | F | G | G | M | A | W | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | N | K | K | K | I | D | G | L | L | I | D | Q | I | Q | R | D | L | V | D | D | A | A | S | L | V | Q | L | Y | H | I | L | H | P | D | G | Q | S | A | Q | E | A | K | E | Q | A | A | E | G | L | Q | L | I | K | V | F | A | K | T | E | A | Q | K | G | A | Y | I | E | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | Q | A | Y | Q | E | A | F | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|