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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jb9j_ | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: J: PDB Molecule: small nuclear ribonucleoprotein g; | PDBTitle: cryo-em structure of the yeast spliceosome at 3.6 angstrom resolution |
Added to library: Sat Sep 26 09:06:24 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | L | N | A | E | F | L | S | Q | V | P | S | F | I | S | P | L | K | E | T | E | L | D | L | R | Q | I | P | I | I | E | N | L | G | V | L | R | D | V | H | D | A | I | D | F | T | D | N | D | I | R | Y | L | G | N | F | P | R | M | K | R | L | Q | T | L | L | C | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | R | I | T | A | I | A | P | D | I | G | K | V | L | P | N | L | K | T | L | S | L | A | Q | N | H | L | Q | E | I | A | D | L | D | P | L | A | S | C | P | Q | L | T | N | L | S | C | I | D | N | P | V | A | Q | K | Q | Y | Y | R | L | Y | L | I | W | R | I | P | S | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G | G | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | |||||||||||||||||||||
Sequence | I | L | D | F | E | R | V | R | R | N | E | R | L | R | A | E | E | V | F | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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