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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jb9d_ | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: D: PDB Molecule: small nuclear ribonucleoprotein sm d3; | PDBTitle: cryo-em structure of the yeast spliceosome at 3.6 angstrom resolution |
Added to library: Sat Sep 26 08:55:21 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | N | V | E | L | Q | T | S | L | G | K | I | L | I | E | L | Y | T | E | H | A | P | K | T | C | Q | N | F | Y | T | L | A | K | E | G | Y | Y | D | G | V | I | F | H | R | V | I | P | D | F | V | I | Q | G | G | D | P | T | G | T | G | R | G | G | T | S | I | Y | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | D | D | E | I | H | S | D | L | H | H | T | G | A | G | I | L | S | M | A | N | A | G | P | N | T | N | S | S | Q | F | F | I | T | L | A | P | T | P | W | L | D | G | K | H | T | I | F | G | R | V | V | S | G | L | S | V | C | K | R | M | G | L | I | R | T | D | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | R | P | I | E | P | L | K | I | I | K | A | V | A | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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