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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jb9a_ | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: A: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor spp42; | PDBTitle: cryo-em structure of the yeast spliceosome at 3.6 angstrom resolution |
Added to library: Sat Sep 26 08:32:13 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | P | S | I | C | E | R | C | L | G | D | N | S | Y | V | R | M | T | K | E | P | L | G | Q | E | C | K | I | C | S | K | P | C | T | I | F | R | W | I | K | E | R | G | Q | K | P | G | K | T | Q | I | C | V | G | C | A | R | Y | K | N | C | C | Q | S | C | M | L | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | B | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | F | G | L | P | I | A | L | R | D | A | A | L | K | L | V | E | S | G | P | T | N | D | I | N | R | E | F | F | A | Q | N | Q | Q | R | L | L | S | N | G | E | T | A | Y | D | S | Q | E | A | S | A | A | A | R | N | L | V | K | K | V | E | K | R | E | X | X | X | X | X | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | A | S | L | N | A | E | R | A | D | Y | K | I | R | K | H | F | E | Q | Y | G | P | L | K | S | V | V | C | S | H | R | A | K | C | A | F | V | N | F | K | T | R | S | S | A | E | I | A | A | A | A | S | P | D | G | N | V | L | K | V | Q | W | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | K | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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