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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jb4C_ | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: vp3; | PDBTitle: structure of ljungan virus: insight into picornavirus packaging |
Added to library: Sat Oct 24 14:00:32 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | V | R | K | T | K | T | S | K | F | K | W | V | R | N | K | I | D | I | A | E | G | P | G | A | M | N | I | A | N | V | L | S | T | T | G | G | Q | T | I | A | L | V | G | E | R | A | F | Y | D | P | R | T | A | G | A | A | V | R | C | K | D | L | M | E | I | A | R | M | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | F | L | G | E | S | T | E | P | D | G | R | R | G | Y | F | T | W | S | H | T | I | S | P | V | N | W | V | F | D | D | H | I | Y | L | E | N | M | P | N | L | R | L | F | S | S | C | Y | N | Y | W | R | G | S | F | V | I | K | L | T | V | Y | A | S | T | F | N | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | L | R | M | A | F | F | P | N | R | E | G | A | Y | T | Q | D | D | A | Q | N | A | I | F | V | V | C | D | I | G | L | N | N | T | F | E | M | T | I | P | Y | T | W | G | N | W | M | R | P | T | R | G | N | S | L | G | H | L | R | I | D | V | L | N | R | L | T | Y | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | ||||||||||||||||||
Sequence | S | S | P | N | A | V | N | C | I | L | Q | I | K | M | G | D | D | A | M | F | M | V | P | T | T | S | N | L | V | M | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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