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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3jb4A_ | PDB header: virus | Chain: A: PDB Molecule: vp1; | PDBTitle: structure of ljungan virus: insight into picornavirus packaging |
Added to library: Sat Oct 24 13:59:36 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | V | E | A | A | Q | G | E | E | L | A | T | E | V | G | L | R | A | T | E | N | D | G | S | L | S | E | Q | L | N | M | S | Q | P | M | F | L | N | F | K | K | H | K | V | N | I | Y | A | A | T | H | T | K | V | D | H | I | F | G | R | A | W | A | V | G | V | F | N | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | A | I | Q | K | F | D | L | H | F | P | T | S | T | H | G | A | L | S | R | F | F | C | H | W | T | G | E | L | N | I | H | I | L | N | V | S | T | T | N | A | F | L | K | V | A | H | T | W | F | G | T | D | S | G | I | A | R | T | A | T | L | E | S | N | G | T | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | S | B | S | S | S | B | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | P | P | N | E | Q | M | T | L | C | V | P | Y | Y | S | E | V | P | L | R | C | V | K | G | S | D | R | N | S | A | G | L | G | S | L | F | T | Q | A | V | G | R | T | I | S | N | R | V | Q | I | F | V | S | F | R | C | P | N | F | F | F | P | L | P | A | P | R | E | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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