|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3j98J_ | PDB header: hydrolase | Chain: J: PDB Molecule: alpha-soluble nsf attachment protein; | PDBTitle: structure of 20s supercomplex determined by single particle2 cryoelectron microscopy (state iiia) |
Added to library: Sat Jan 31 08:36:35 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | E | A | M | A | L | L | A | E | A | E | R | K | V | K | N | S | Q | S | F | F | S | G | L | F | G | G | S | S | K | I | E | E | A | C | E | I | Y | A | R | A | A | N | M | F | K | M | A | K | N | W | S | A | A | G | N | A | F | C | Q | A | A | Q | L | H | L | Q | L | Q | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | H | D | A | A | T | C | F | V | D | A | G | N | A | F | K | K | A | D | P | Q | E | A | I | N | C | L | M | R | A | I | E | I | Y | T | D | M | G | R | F | T | I | A | A | K | H | H | I | S | I | A | E | I | Y | E | T | E | L | V | D | V | E | K | A | I | A | H | Y | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | A | D | Y | Y | K | G | E | E | S | N | S | S | A | N | K | C | L | L | K | V | A | G | Y | A | A | Q | L | E | Q | Y | Q | K | A | I | D | I | Y | E | Q | V | G | T | S | A | M | D | S | P | L | L | K | Y | S | A | K | D | Y | F | F | K | A | A | L | C | H | F | C | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | M | L | N | A | K | L | A | V | Q | K | Y | E | E | L | F | P | A | F | S | D | S | R | E | C | K | L | M | K | K | L | L | E | A | H | E | E | Q | N | V | D | S | Y | T | E | S | V | K | E | Y | D | S | I | S | R | L | D | Q | W | L | T | T | M | L | L | R | I | K | K | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | G | D | E | E | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|