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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j8cM_ | PDB header: translation | Chain: M: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 3 subunit m; | PDBTitle: model of the human eif3 pci-mpn octamer docked into the 43s em map |
Added to library: Sat Oct 25 09:10:25 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | G | S | Y | T | E | D | N | A | S | Q | A | R | V | D | A | H | R | C | I | V | R | A | L | K | D | P | N | A | F | L | F | D | H | L | L | T | L | K | P | V | K | F | L | E | G | E | L | I | H | D | L | L | T | I | F | V | S | A | K | L | A | S | Y | V | K | F | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | N | K | D | F | I | D | S | L | G | L | L | H | E | Q | N | M | A | K | M | R | L | L | T | F | M | G | M | A | V | E | N | K | E | I | S | F | D | T | M | Q | Q | E | L | Q | I | G | A | D | D | V | E | A | F | V | I | D | A | V | R | T | K | M | V | Y | C | K | I | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | S | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | Q | R | K | V | V | V | S | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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