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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j8cL_ | PDB header: translation | Chain: L: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 3 subunit l; | PDBTitle: model of the human eif3 pci-mpn octamer docked into the 43s em map |
Added to library: Sat Oct 25 09:14:20 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | M | L | G | Y | F | S | L | V | G | L | L | R | L | H | S | L | L | G | D | Y | Y | Q | A | I | K | V | L | E | N | I | E | L | N | K | K | S | M | Y | S | R | V | P | E | C | Q | V | T | T | Y | Y | Y | V | G | F | A | Y | L | M | M | R | R | Y | Q | D | A | I | R | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | N | I | L | L | Y | I | Q | R | T | K | S | M | F | Q | R | T | T | Y | K | Y | E | M | I | N | K | Q | N | E | Q | M | H | A | L | L | A | I | A | L | T | M | Y | P | M | R | I | D | E | S | I | H | L | Q | L | R | E | K | Y | G | D | K | M | L | R | M | Q | K | G | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | V | Y | E | E | L | F | S | Y | S | C | P | K | F | L | S | E | P | F | L | Q | Q | L | K | V | F | S | D | E | V | Q | Q | Q | A | Q | L | S | T | I | R | S | F | L | K | L | Y | T | T | M | P | V | A | K | L | A | G | F | L | D | L | T | E | Q | E | F | R | I | Q | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | V | F | K | H | K | M | K | N | L | V | W | T | S | G | I | S | A | L | D | G | E | F | Q | S | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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