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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j80g_ | PDB header: ribosome | Chain: G: PDB Molecule: es6; | PDBTitle: cryoem structure of 40s-eif1-eif1a preinitiation complex |
Added to library: Sat Nov 8 09:02:44 2014 | |
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Sequence | S | S | N | I | M | L | V | L | R | G | T | L | E | G | H | N | G | W | V | T | S | L | S | T | S | A | A | Q | P | N | L | L | V | S | G | S | R | D | K | T | L | I | S | W | R | L | T | E | N | E | Q | Q | F | G | V | P | V | R | S | Y | K | G | H | S | H | I | V | Q | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | S | A | D | G | N | Y | A | V | S | A | S | W | D | K | T | L | R | L | W | N | L | A | T | G | N | S | E | A | R | F | V | G | H | T | G | D | V | L | S | V | A | I | D | A | N | S | S | K | I | I | S | A | S | R | D | K | T | I | R | V | W | N | T | V | G | D | C | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | V | L | L | G | H | T | D | W | V | T | K | V | R | V | A | P | K | N | L | V | D | D | G | R | I | T | F | V | S | A | G | M | D | K | I | V | R | S | W | S | L | N | S | Y | R | I | E | A | D | F | I | G | H | N | N | Y | I | N | V | V | Q | P | S | P | D | G | S | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | S | A | G | K | D | G | Q | I | Y | V | W | N | L | K | H | K | S | A | F | M | N | F | D | A | K | D | E | V | F | A | L | A | F | S | P | S | R | F | W | L | T | A | A | T | A | S | G | I | K | I | Y | D | L | E | N | E | V | L | I | D | E | L | K | P | E | F | A | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | T | K | A | Q | D | P | H | A | V | S | L | A | W | S | A | D | G | Q | T | L | F | A | G | Y | T | D | N | V | I | R | V | W | Q | V | M | T | A | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S |
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