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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j39E_ | PDB header: ribosome | Chain: E: PDB Molecule: 60s ribosomal protein l6, isoform a; | PDBTitle: structure of the d. melanogaster 60s ribosomal proteins |
Added to library: Sat May 4 08:47:37 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | G | K | K | H | P | V | N | S | Y | L | K | G | G | I | L | R | Y | S | K | A | Q | M | Y | K | R | R | A | L | Y | R | L | K | D | K | K | S | P | V | V | E | K | A | K | V | P | I | K | K | S | K | A | S | Y | P | T | K | T | F | V | K | K | R | P | S | K | A | N | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | H | K | R | N | T | R | R | N | L | T | P | G | T | V | L | I | L | L | A | G | R | H | Q | G | K | R | V | V | L | L | K | V | L | A | S | G | L | L | L | V | T | G | P | F | A | L | N | S | C | P | L | R | R | V | S | Q | R | Y | V | I | G | T | S | S | K | V | D | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | K | V | P | E | H | L | N | D | A | Y | F | R | R | L | K | A | K | K | D | K | K | T | G | E | A | D | I | F | A | A | K | K | E | R | F | V | P | N | E | Q | R | K | K | D | Q | K | E | V | D | A | A | L | L | K | V | I | K | A | H | P | E | G | K | F | F | A | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | Q | N | M | F | A | L | H | S | S | Q | Y | P | H | R | M | R | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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